南平市属中低山丘陵构造侵蚀地貌。东西有鹫峰山脉和武夷山脉雄峙，北有仙霞岭支脉屏障，地形系呈向中、向南倾斜的马蹄状盆地。建溪自东北流向西南，富屯溪自西北流向东南，沙溪自西南流向东北，于延平区汇合后（称闽江）向东南流经福州马尾入海。境内山峦逶迤，溪流纵横，沿溪有河谷平原。武夷山脉的黄岗山，海拔2158米，是我国大陆东南部第一高峰。山上有林，平原有田，是福建省的“林海粮仓”。

        南平市属中亚热带季风气候，温暖湿润，四季分明，年均降雨量在1600—1800毫米之间，加上地势高低悬殊，水力资源极为丰富。但在梅雨季节极易造成洪涝灾害。

        南平市境内河流众多，流域面积在50平方千米以上的溪河有176条，100平方千米以上的河流有70条。主要河流有“一江八溪”，即闽江、建溪、富屯溪、崇阳溪、南浦溪、松溪、麻溪、沙溪和金溪，其中闽江流域面积60992平方千米，河长541千米，境内长75千米。建溪流域面积16396平方千米，占闽江流域面积的27％，河长294千米。富屯溪流域面积13733平方千米，占闽江流域面积的22.5％，在南平境内面积占闽江流域面积的11％，河长285千米。

        南平市土地总面积26280.6平方千米，折合3945.15万亩，其中，山地面积3167万亩，占全市土地总面积的80.28％；人均近15亩，是福建省人均山地最多的地区。耕地302.24万亩，占总面积的8.12％，人均1.5亩。水域面积160.47万亩，占总面积4.07％；水资源总量272亿立方米（含浅层地下水），占福建省水资源总量的23.3％；水能理论蕴藏量331.33万千瓦时，可开发利用量120万千瓦时，已开发利用16.7％。森林资源丰富，拥有林业用地面积3176.98万亩，有林地2251.57万亩，疏林地164.89万亩，灌木林地116.54万亩，未成林造林地421.35万亩，无林地222.48万亩。有林地面积中，用材林1404.48万亩，占62.4％；防护林157.58万亩，占6.9％；特用林71.68万亩，占3.2％；薪炭林1.91万亩，占0.1％；经济林240.82万亩，占10.7％；竹林375.10万亩，占16.7％。活立木总蓄积量11538.7万立方米，其中林分蓄积量9686.0万立方米。拥有武夷山国家级自然保护区，及万木林、将石等省级自然保护区。

        南平市已知矿种有50余种。探明储量的有萤石、铅锌、硫铁矿、石墨、水晶、水泥灰石等31种。矿床点700处，其中金属矿床点301处，占总矿床的40％。其中莹石远景储量3000万吨以上，占全省保有储量的95％，有大型矿床3处，中型矿床4处，小型矿床8处；铅的保有储量51.35万吨，占全省的50％，锌的保有储量69.93万吨，占全省的45.5％，有矿床31处；硫铁矿分布较广，大型矿床1处，中型2处，小型5处，储量占全省的55.8％；等等。

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